Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTN1P12814 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms