Protein–RNA interactions for Protein: P11488

GNAT1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAT1P11488 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GNAT1P11488 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNAT1P11488 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNAT1P11488 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNAT1P11488 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNAT1P11488 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNAT1P11488 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNAT1P11488 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNAT1P11488 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNAT1P11488 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNAT1P11488 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNAT1P11488 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNAT1P11488 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNAT1P11488 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNAT1P11488 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNAT1P11488 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNAT1P11488 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNAT1P11488 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNAT1P11488 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNAT1P11488 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNAT1P11488 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNAT1P11488 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNAT1P11488 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNAT1P11488 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNAT1P11488 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms