Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RALAP11233 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RALAP11233 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RALAP11233 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RALAP11233 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RALAP11233 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RALAP11233 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RALAP11233 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALAP11233 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALAP11233 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALAP11233 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALAP11233 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALAP11233 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALAP11233 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALAP11233 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALAP11233 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALAP11233 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALAP11233 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RALAP11233 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALAP11233 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALAP11233 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALAP11233 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALAP11233 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALAP11233 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALAP11233 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALAP11233 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALAP11233 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALAP11233 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALAP11233 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALAP11233 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALAP11233 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALAP11233 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALAP11233 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALAP11233 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALAP11233 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALAP11233 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALAP11233 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALAP11233 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALAP11233 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALAP11233 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RALAP11233 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALAP11233 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALAP11233 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALAP11233 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALAP11233 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALAP11233 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALAP11233 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALAP11233 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALAP11233 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALAP11233 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALAP11233 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RALAP11233 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RALAP11233 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RALAP11233 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RALAP11233 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RALAP11233 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RALAP11233 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RALAP11233 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RALAP11233 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RALAP11233 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RALAP11233 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RALAP11233 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RALAP11233 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RALAP11233 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RALAP11233 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RALAP11233 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RALAP11233 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALAP11233 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALAP11233 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALAP11233 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALAP11233 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALAP11233 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RALAP11233 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALAP11233 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALAP11233 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALAP11233 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALAP11233 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALAP11233 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALAP11233 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RALAP11233 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALAP11233 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALAP11233 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALAP11233 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALAP11233 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALAP11233 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALAP11233 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALAP11233 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RALAP11233 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALAP11233 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALAP11233 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALAP11233 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALAP11233 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALAP11233 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALAP11233 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALAP11233 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALAP11233 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALAP11233 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALAP11233 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALAP11233 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALAP11233 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms