Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB41P11171 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB41P11171 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB41P11171 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB41P11171 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB41P11171 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB41P11171 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB41P11171 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41P11171 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41P11171 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41P11171 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41P11171 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41P11171 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41P11171 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41P11171 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41P11171 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41P11171 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41P11171 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41P11171 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41P11171 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41P11171 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41P11171 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB41P11171 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB41P11171 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41P11171 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41P11171 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41P11171 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41P11171 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41P11171 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41P11171 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41P11171 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41P11171 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41P11171 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41P11171 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41P11171 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41P11171 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41P11171 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPB41P11171 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPB41P11171 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPB41P11171 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPB41P11171 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPB41P11171 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPB41P11171 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41P11171 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41P11171 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41P11171 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41P11171 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41P11171 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41P11171 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41P11171 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41P11171 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41P11171 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41P11171 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41P11171 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41P11171 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41P11171 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41P11171 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41P11171 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41P11171 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41P11171 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41P11171 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41P11171 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41P11171 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41P11171 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41P11171 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41P11171 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41P11171 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41P11171 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41P11171 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41P11171 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41P11171 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41P11171 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41P11171 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41P11171 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms