Protein–RNA interactions for Protein: P10809

HSPD1, 60 kDa heat shock protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPD1P10809 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSPD1P10809 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSPD1P10809 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms