Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
U2AF1L5P0DN76 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
U2AF1L5P0DN76 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms