Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM10L2AP0DMW4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms