Protein–RNA interactions for Protein: P0CG21

NHLRC4, NHL-repeat-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC4P0CG21 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NHLRC4P0CG21 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NHLRC4P0CG21 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms