Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC172P0C7W6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms