Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I0

USP17L8, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L8P0C7I0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L8P0C7I0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
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