Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP3P08254 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP3P08254 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP3P08254 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP3P08254 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP3P08254 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP3P08254 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP3P08254 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP3P08254 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP3P08254 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP3P08254 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP3P08254 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP3P08254 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP3P08254 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP3P08254 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP3P08254 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP3P08254 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP3P08254 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP3P08254 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP3P08254 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP3P08254 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP3P08254 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP3P08254 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP3P08254 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP3P08254 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP3P08254 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP3P08254 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP3P08254 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP3P08254 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP3P08254 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP3P08254 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP3P08254 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP3P08254 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP3P08254 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP3P08254 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP3P08254 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP3P08254 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP3P08254 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP3P08254 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP3P08254 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP3P08254 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP3P08254 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP3P08254 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP3P08254 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP3P08254 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP3P08254 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP3P08254 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP3P08254 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP3P08254 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP3P08254 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP3P08254 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP3P08254 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP3P08254 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP3P08254 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP3P08254 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP3P08254 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP3P08254 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP3P08254 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP3P08254 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP3P08254 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP3P08254 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP3P08254 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP3P08254 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP3P08254 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP3P08254 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP3P08254 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP3P08254 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP3P08254 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP3P08254 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP3P08254 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP3P08254 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP3P08254 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP3P08254 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP3P08254 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP3P08254 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP3P08254 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP3P08254 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP3P08254 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP3P08254 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP3P08254 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP3P08254 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP3P08254 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP3P08254 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP3P08254 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP3P08254 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP3P08254 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP3P08254 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP3P08254 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP3P08254 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP3P08254 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP3P08254 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP3P08254 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP3P08254 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP3P08254 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP3P08254 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP3P08254 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP3P08254 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP3P08254 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP3P08254 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP3P08254 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms