Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSF1RP07333 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms