Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HLA-DOAP06340 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DOAP06340 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms