Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB3P05106 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB3P05106 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms