Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFNB1P01574 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms