Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMP1P01033 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMP1P01033 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms