Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYF2O95926 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYF2O95926 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYF2O95926 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYF2O95926 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYF2O95926 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYF2O95926 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYF2O95926 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYF2O95926 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYF2O95926 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYF2O95926 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYF2O95926 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYF2O95926 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYF2O95926 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYF2O95926 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYF2O95926 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYF2O95926 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYF2O95926 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYF2O95926 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYF2O95926 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYF2O95926 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYF2O95926 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYF2O95926 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYF2O95926 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYF2O95926 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYF2O95926 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYF2O95926 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYF2O95926 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYF2O95926 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYF2O95926 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYF2O95926 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYF2O95926 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYF2O95926 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYF2O95926 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYF2O95926 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYF2O95926 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYF2O95926 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYF2O95926 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYF2O95926 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYF2O95926 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYF2O95926 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYF2O95926 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SYF2O95926 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYF2O95926 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SYF2O95926 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYF2O95926 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYF2O95926 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYF2O95926 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYF2O95926 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYF2O95926 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYF2O95926 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SYF2O95926 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SYF2O95926 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYF2O95926 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYF2O95926 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYF2O95926 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYF2O95926 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYF2O95926 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SYF2O95926 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYF2O95926 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYF2O95926 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYF2O95926 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYF2O95926 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYF2O95926 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SYF2O95926 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYF2O95926 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYF2O95926 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYF2O95926 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYF2O95926 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYF2O95926 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYF2O95926 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYF2O95926 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYF2O95926 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYF2O95926 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYF2O95926 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYF2O95926 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYF2O95926 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYF2O95926 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYF2O95926 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYF2O95926 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYF2O95926 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYF2O95926 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYF2O95926 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYF2O95926 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYF2O95926 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYF2O95926 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYF2O95926 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYF2O95926 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYF2O95926 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYF2O95926 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYF2O95926 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYF2O95926 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYF2O95926 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYF2O95926 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYF2O95926 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYF2O95926 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYF2O95926 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYF2O95926 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SYF2O95926 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYF2O95926 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms