Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4FO95754 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4FO95754 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms