Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN15O75808 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN15O75808 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms