Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXO3O43524 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXO3O43524 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms