Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
GPAA1O43292 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAA1O43292 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms