Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CITO14578 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CITO14578 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CITO14578 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CITO14578 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CITO14578 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CITO14578 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CITO14578 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CITO14578 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CITO14578 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CITO14578 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CITO14578 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CITO14578 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CITO14578 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CITO14578 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CITO14578 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CITO14578 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CITO14578 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CITO14578 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CITO14578 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CITO14578 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CITO14578 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CITO14578 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CITO14578 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CITO14578 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CITO14578 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CITO14578 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CITO14578 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CITO14578 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CITO14578 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CITO14578 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CITO14578 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CITO14578 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CITO14578 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CITO14578 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CITO14578 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CITO14578 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CITO14578 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CITO14578 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CITO14578 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CITO14578 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CITO14578 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CITO14578 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CITO14578 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CITO14578 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CITO14578 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CITO14578 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CITO14578 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CITO14578 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CITO14578 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CITO14578 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CITO14578 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CITO14578 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CITO14578 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CITO14578 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CITO14578 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CITO14578 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CITO14578 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CITO14578 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CITO14578 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CITO14578 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CITO14578 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CITO14578 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CITO14578 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CITO14578 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CITO14578 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CITO14578 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CITO14578 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CITO14578 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CITO14578 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CITO14578 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CITO14578 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CITO14578 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CITO14578 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CITO14578 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CITO14578 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CITO14578 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CITO14578 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CITO14578 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CITO14578 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CITO14578 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CITO14578 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CITO14578 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CITO14578 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CITO14578 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CITO14578 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CITO14578 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CITO14578 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CITO14578 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CITO14578 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CITO14578 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CITO14578 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CITO14578 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CITO14578 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CITO14578 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CITO14578 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CITO14578 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CITO14578 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CITO14578 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CITO14578 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms