Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP1O00294 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP1O00294 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP1O00294 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP1O00294 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP1O00294 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP1O00294 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP1O00294 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP1O00294 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP1O00294 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP1O00294 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP1O00294 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP1O00294 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP1O00294 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP1O00294 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP1O00294 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP1O00294 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP1O00294 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP1O00294 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP1O00294 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP1O00294 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP1O00294 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP1O00294 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP1O00294 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP1O00294 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP1O00294 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP1O00294 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP1O00294 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP1O00294 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP1O00294 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP1O00294 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP1O00294 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP1O00294 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP1O00294 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP1O00294 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP1O00294 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP1O00294 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP1O00294 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP1O00294 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP1O00294 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP1O00294 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP1O00294 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP1O00294 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP1O00294 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP1O00294 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP1O00294 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP1O00294 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP1O00294 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP1O00294 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP1O00294 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP1O00294 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP1O00294 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP1O00294 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP1O00294 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP1O00294 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP1O00294 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP1O00294 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP1O00294 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP1O00294 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP1O00294 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP1O00294 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP1O00294 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP1O00294 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP1O00294 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP1O00294 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP1O00294 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP1O00294 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP1O00294 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP1O00294 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP1O00294 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP1O00294 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP1O00294 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP1O00294 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP1O00294 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP1O00294 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP1O00294 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP1O00294 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP1O00294 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP1O00294 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP1O00294 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP1O00294 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP1O00294 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP1O00294 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP1O00294 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP1O00294 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP1O00294 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP1O00294 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP1O00294 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP1O00294 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP1O00294 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP1O00294 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP1O00294 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP1O00294 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP1O00294 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP1O00294 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP1O00294 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP1O00294 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP1O00294 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP1O00294 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP1O00294 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms