Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN8O00124 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN8O00124 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN8O00124 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN8O00124 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN8O00124 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN8O00124 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN8O00124 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN8O00124 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN8O00124 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN8O00124 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN8O00124 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN8O00124 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN8O00124 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN8O00124 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms