Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms