Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRDCB7Z8K6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms