Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF233A6NK53 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms