Protein–RNA interactions for Protein: A6NJR5

Putative speedy protein-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NJR5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NJR5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NJR5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NJR5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NJR5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NJR5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NJR5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NJR5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NJR5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NJR5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NJR5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NJR5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NJR5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NJR5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NJR5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NJR5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NJR5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NJR5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NJR5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NJR5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NJR5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NJR5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NJR5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NJR5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NJR5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NJR5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NJR5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NJR5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NJR5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NJR5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NJR5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NJR5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NJR5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NJR5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NJR5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NJR5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NJR5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NJR5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NJR5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NJR5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NJR5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NJR5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NJR5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NJR5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NJR5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NJR5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NJR5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NJR5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NJR5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NJR5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NJR5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A6NJR5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A6NJR5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A6NJR5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NJR5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NJR5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NJR5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NJR5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NJR5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NJR5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NJR5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NJR5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NJR5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NJR5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NJR5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NJR5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NJR5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NJR5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NJR5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NJR5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NJR5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NJR5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NJR5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NJR5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NJR5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NJR5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NJR5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NJR5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NJR5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NJR5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NJR5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NJR5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NJR5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NJR5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NJR5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NJR5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NJR5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NJR5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NJR5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NJR5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NJR5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NJR5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NJR5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NJR5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NJR5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NJR5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NJR5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NJR5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NJR5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NJR5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms