Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEMA6NI47 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEMA6NI47 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms