Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGPEP1LA6NFU8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGPEP1LA6NFU8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGPEP1LA6NFU8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGPEP1LA6NFU8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGPEP1LA6NFU8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGPEP1LA6NFU8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGPEP1LA6NFU8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGPEP1LA6NFU8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGPEP1LA6NFU8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGPEP1LA6NFU8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PGPEP1LA6NFU8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGPEP1LA6NFU8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms