Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L9A6NEM1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L9A6NEM1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms