Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMX2A2RU54 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMX2A2RU54 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms