Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN7Q9Y6W3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms