Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
LINC00312Q9Y6C7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms