Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX9Q9Y5X1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms