Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSC4Q9Y5U2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSC4Q9Y5U2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms