Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms