Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms