Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms