Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCF2Q9UG63 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms