Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARHGAP28Q9P2N2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms