Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH10Q9P2E7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms