Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms