Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSD3Q9NYI0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSD3Q9NYI0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms