Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms