Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms