Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY99

SNTG2, Gamma-2-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG2Q9NY99 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNTG2Q9NY99 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNTG2Q9NY99 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNTG2Q9NY99 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNTG2Q9NY99 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNTG2Q9NY99 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNTG2Q9NY99 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNTG2Q9NY99 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNTG2Q9NY99 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNTG2Q9NY99 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNTG2Q9NY99 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNTG2Q9NY99 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNTG2Q9NY99 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms