Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX61

TMEM161A, Transmembrane protein 161A, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM161AQ9NX61 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM161AQ9NX61 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms