Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FANCIQ9NVI1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms