Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM30AQ9NV96 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms